②土壤中氮素的转化：土壤中有机态氮占99%以上 ， 无机态氮不足1%;水田的全氮含量约为0.1—0.2% ， 无机态氮更少 。作物从土壤中吸收的氮素 ， 绝大部份由有机氮转化而来 。其转化形成主要有四种：
A、氨化作用：土壤中含氮的有机物 ， 如蛋白质、尿素和壳糖（几丁质）等在氨化细菌作用下 ， 逐渐分解释放出氨 ， 称之氨化作用 。不论通气好坏 ， 此过程都能进行 。氨与土壤中的酸根结合成铵盐 ， 为作物吸收利用 ， 或被土壤胶体吸附保存 。
B、硝化作用：氨或铵盐在通气良好的条件下 ， 经亚硝酸细菌、硝酸细菌等的作用 ， 转化成硝酸的过程 ， 称为硝化作用 。由于这种作用是在通气良好的情况下进行 ， 所以NO3-N存在于旱土中 ， 而水田中很少见 。NO3-N是作物良好的有效态养分 ， 但不能被土壤胶体吸附 ， 易于随水流失 ， 故深耕松土 ， 保持土壤湿润 ， 有利硝化作用和防止土壤中氨的散失 。
C、反硝化作用：当土壤通气不良 ， 并含有大量新鲜有机质和硝酸盐的土壤中 ， 在反硝化细菌的作用下 ， 将硝酸盐还原成作物不能利用的氮气而损失 ， 这个过程称为反硝化作用 。这种作用对作物吸收养分和生长带来不利 ， 务必加以阻止 。稻田采用浅水间灌 ， 露田通气和施用铵态氮肥 ， 旱土雨后中耕松土 ， 均可防止反硝化作用的发生 。
D、生物夺氮作用：土壤中的无机态氮（如铵盐、硝酸盐）部份被微生物、杂草、土壤动物吸收利用 ， 合成生物机体 ， 使土壤有效态氮减少 ， 称生物夺氮作用 。尤以微生物夺氮最突出 ， 当土壤中施用大量新鲜的、含纤维素多的有机肥和其它环境条件又适宜 ， 微生物就大量活动与繁殖 ， 消耗掉土壤中有效氮素 ， 从而导致作物氮素养分缺乏或严重不足 。因此 ， 凡秸秆还田或施用大量未腐熟的含纤维多的有机肥料 ， 必须配合施用适当的速效氮肥 ， 以补充土壤有效氮素 ， 供作物吸收 。
但是生物夺氮作用是暂时的 ， 直到有机肥分解就会停止 ， 同时 ， 微生物死亡后 ， 氮素仍就归还给土壤 ， 让作物吸收利用 。所以这与反硝化作用造成的氮素损失是完全不同的 。
③土壤中磷素的转化：一般土壤中磷酸总量（以P2O5计算）约在0.05~0.2%之间 。红黄壤仅为0.06%左右 ， 就按此计算 ， 这些磷也够供作物若干年丰收所需要 。但是 ， 土壤中能为作物很好吸收利用的水溶性磷（如Na、K、NH4等磷酸盐及磷酸一钙）和弱酸溶性磷（如磷酸二钙）很少；而多数为难溶性磷（磷酸二钙）和极难溶性磷（如磷酸铁、磷酸铝）以及有机态磷 。它们需经各种转化 ， 才能被作物吸收利用 。
土壤无机磷的转化 ， 主要受土壤反应的影响 。在强酸性土壤中 ， 磷与铁、铝离子化合生成难溶性的磷酸铁、磷酸铝沉淀而被土壤固定；在石灰性土壤中 ， 磷则成为磷酸三钙被土壤固定 。只有当土壤反应处于中性或接近中性（PH值为6.5~7.5）的条件 ， 磷的有效性才提高 。
土壤有机磷的转化 。土壤中 ， 有机磷化合物主要有核蛋白、核酸、卵磷脂、植素以及植物体内其他含磷化合物 。它们是在土壤微生物的作用下 ， 进行水解释放出磷酸 。这种磷酸和水解性磷一样 ， 在土壤中再进行着各种转化 ， 变成有效磷酸盐供作物吸收利用 。
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