如大、中型动物，或家禽、仔猪等小动物尸体数量不多时，可将尸体置于坑中后，加土覆盖，覆盖土层厚度不得低于0.7米 。小动物尸体数量较多时，可分层掩埋，每层尸体厚度一般不超过0.3米，中间覆土至少0.3米，依次分层掩埋，最后覆盖土层厚度不得低于0.7米 。掩埋过程中，掩土不得压实，以免影响自然腐化 。条件许可时，坑底和动物尸体上应铺撒生石灰 。尸体掩埋后，应防止野生动物刨挖 。
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